基于转录组学和蛋白质组学的高海拔肺动脉高压大鼠模型的新途径

肝动脉冷却（PH）是指静息时平均肝动脉压≥25 mmHg。 它根据血流动力学时特征、发病前提和病理学时分为五类。 第三类的沙漠肝动脉冷却（HAPH）是由于在的沙漠肝部生存环境中的肝换气量代偿性增加和肝小动脉血管收缩引起的，所致山区域心肌病。 针灸症状包括运动性呼吸困难、头痛和疲劳。 HAPH 确实反映了未能适应的沙漠，并伴有不明确的病理生理前提。 大约有 1.4 亿人生活在海拔 2,500 米以上的区域，每年有超过 4,000 万人会面这些的沙漠区域。 肝部所致器官遗传物质理解谱暴发区别暴发变转化； 这是从长期居住在的沙漠区域的当地人及其后代的遗传物质型可操作性暴发变转化中的知悉的。HAPH 的病人仍在统计分析中的。应建议患者转回低海拔区域，氧疗直接。类固醇病人的统计分析仅限于一些随机试验性。 HAPH 的病理与其他类型的 PH 相似，因此很多人再考虑对 PAH 直接的类固醇有否对 HAPH 直接。

然而，所有这些抑制剂类固醇都在HAPH中的的直接性和前提尚不明确。为了解决这个问题，我们旨在统计分析肝部所涉及的分子可前提，常用小鼠 HAPH 模型，并广泛应用综合的大学时新方法。 在此过程中的，我们旨在统计分析几种抑制剂类固醇和复氧的抑制作用，以确定的沙漠引起的肝部的潜在新的病人机理。 特别是，我们统计分析了抑制剂类固醇如何冲击器官之间的区别遗传物质和蛋白质理解。

统计分析设计：

将小鼠置于 10% O2（肝部）室中的 3 周以造成 PH。对照小鼠（C 组）在整个实验中的都处于常氧生存环境下，并在病人期间（即从第 21 天开始）用载体透过病人。 3周时，其余小鼠随机分为六组；都由被处死（第 21 天）以分析心肝功能。其余 5 组用抑制剂类固醇或复氧病人，从第 21 天到第 35 天处死。慢性肝部，载体处理（M）；慢性肝部，司来帕格病人；慢性肝部，马西替坦病人；慢性肝部，riociguat 病人；慢性肝部、复氧 (RE)。

特异性组统计分析：

提取总 RNA，并通过常用 Arraystar rRNA Removal Kit 去除 rRNA 来富含 mRNA 和非解码 RNA。 mRNA 和非解码 RNA 被图片转化缓冲液分解成动画短图片（~200-500 nt）。以动画短图片为常量，利用随机六聚体引物裂解第一链cDNA。在第二链裂解过程中的，dTTP 被 dUTP 改用。 然后加入洗脱缓冲液以通过顶端修复和去掉核苷酸来提纯和分立动画短图片。 动画短图片被提纯并与接头直达； 常用尿嘧啶-N-糖基转化酶消转化第二条链。 琼脂糖单链后，选择合理的图片作为常量透过PCR逐次。 常用 Agilent 2100 生物统计分析仪和 ABI StepOnePlus 实时 PCR 系统对材料库透过定量和质量分析。 该小学馆常用 Illumina HiSeq 2000 系统透过测序。

LC-MS/MS 统计分析

在直达到 Easy-nLC 1000 反应物材料系统的Q Exactive HF 质谱仪上统计分析材料。将干燥的肽材料重新的溶解在溶剂 A（0.1% 乙酸水溶液）中的并加载到逮集柱中的常用溶剂 A 的最大负荷为 280 bar，然后在自制的 150 μm × 30 cm 硅胶微柱上以 5–35% 的二阶透过分立流动相 B（苯酚和 0.1% 乙酸），水量为 600 nl/min，持续 150 分钟。 QE HF 的 MS 统计分析是在 3e6 离子的自动增益控制目标下透过一次以外扫瞄，然后透过多达 30 次与原始数据之外的 MS/MS 扫瞄具有更高能量的冲撞解离，在 Orbitrap 中的验证到（R = 15,000 在 200 m/z）。

统计分析结果：

基于RNA-seq原始数据的共理解互联网的功能富含统计分析和枢纽分子可深入研究。

基于蛋白质原始数据的共理解互联网的功能富含统计分析和枢纽分子可深入研究。

RNA-seq 和蛋白质组学时揭示了对三种类固醇的反应之间的超强之外性，具有仍然并不相同的效果。GO 富含显示区别理解的遗传物质包括参与代谢调控、特异性和翻译的遗传物质。

司来帕格、马西替坦和复氧可加超强 HAPH。Serpina1、Cryz 和 Cmc1 被深入研究出来，通过的大学时筛选，作为参与HAPH的关键遗传物质。这些发现为 HAPH 的抑制剂类固醇前提提供了新的的哲学思想。

统计分析结论：

Selexipag、macitentan 和复氧显着向西移动了小鼠 HAPH 模型，而 riociguat 的抑制作用较弱。 区别理解的遗传物质参与代谢调控、特异性和翻译。 某些蛋白质受到 HAPH 和病人的冲击。 我们常用的大学时新方法筛选了关键遗传物质 Serpina1、Cryz 和 Cmc1。 这些发现确实有助于更好地了解肝部所涉及的分子可前提，并确实提供新的的病人机理。

文献出处：

Xu X, Li H, Wei Q, Li X, Shen Y, Guo G, Chen Y, He K, Liu C. Novel Targets in a High-Altitude Pulmonary Hypertension Rat Model Based on RNA-seq and Proteomics. Front Med (Lausanne). 2021 Nov 3;8:742436. doi: 10.3389/fmed.2021.742436. PMID: 34805208; PMCID: PMC8595261.